Анализ абортивного материала на анеуплоидии по всем 24 хромосомам (NGS)

Генетическое исследование абортивного материала методом высокопроизводительного секвенирования нового поколения — NGS (Next Generation Sequencing) — проводится для выявления численных нарушений хромосом, которые могли стать причиной самопроизвольного прерывания или неразвивающейся беременности.

В рамках теста анализируются все хромосомы человека: 22 пары аутосом и половые хромосомы X и Y. Исследование позволяет определить наличие лишней или отсутствующей хромосомы, а также ряда других изменений количества хромосомного материала.

Для чего проводится исследование

Значительная часть потерь беременности на ранних сроках связана со случайными хромосомными нарушениями у эмбриона. Такие изменения могут возникать при формировании половых клеток или на ранних этапах развития эмбриона и обычно не зависят от образа жизни женщины.

Анализ абортивного материала помогает установить, была ли потеря беременности связана с численной хромосомной аномалией. Полученная информация может быть полезна для определения дальнейшей тактики обследования пары, оценки репродуктивных рисков и подготовки к следующей беременности.

Что показывает анализ

• трисомии — наличие дополнительной копии одной из хромосом;
• моносомии — отсутствие одной копии хромосомы;
• анеуплоидии половых хромосом X и Y;
• сочетанные численные нарушения нескольких хромосом;
• полиплоидии — изменение количества полных наборов хромосом, если их выявление предусмотрено используемой тест-системой;
• мозаичные хромосомные изменения — при достаточной доле изменённых клеток и наличии соответствующей технической валидации метода.

Показания к проведению теста

• самопроизвольное прерывание беременности;
• неразвивающаяся или замершая беременность;
• анэмбриония;
• привычное невынашивание беременности;
• повторные репродуктивные потери;
• необходимость уточнения возможной причины потери беременности;
• планирование следующей беременности и определение показаний к консультации врача-генетика.

Как проводится исследование

Из предоставленного биологического материала выделяется ДНК. После оценки её количества и качества проводится подготовка генетической библиотеки и высокопроизводительное секвенирование. Полученные данные обрабатываются с помощью специализированных биоинформатических программ, которые оценивают количество генетического материала каждой хромосомы.

На основании анализа формируется лабораторное заключение, в котором указывается, выявлены ли численные хромосомные нарушения и какие именно хромосомы затронуты.

Для анализа могут использоваться ткани плодного яйца или другие фрагменты абортивного материала

Условия хранения и транспортировки биоматериала

• Мы не производим забор материала. Материал отбирается врачом-гинекологом под контролем УЗИ и направляется нам.
• Для исследования используют ткани плода. Для минимизации риска контаминации материнскими клетками рекомендуется по возможности выделять плодные ткани, избегая включения большого количества тканей эндометрия и сгустков крови.
• Материал помещают в стерильный контейнер с физиологическим раствором (0,9% NaCl).
• Не допускается фиксация материала в формалине, так как это приводит к повреждению ДНК и делает проведение анализа методом NGS невозможным.
• До отправки в лабораторию образец следует хранить при температуре +2…+8 °C.
• Рекомендуется доставить материал в лабораторию в течение 24–48 часов после получения.
• Если доставка в указанный срок невозможна, материал допускается заморозить при температуре −20 °C. Следует избегать повторных циклов замораживания и размораживания.
• Не допускаются высыхание образца, длительное хранение при комнатной температуре и загрязнение посторонними тканями.

Преимущества метода NGS

• одновременный анализ всех 24 хромосом;
• высокая аналитическая чувствительность и воспроизводимость;
• не требуется выращивание клеточной культуры;
• возможность проведения исследования на небольшом количестве биологического материала при достаточном качестве ДНК;
• более широкий объём анализа по сравнению с методами, направленными только на отдельные хромосомы;
• возможность получения результата даже в тех случаях, когда стандартное кариотипирование затруднено из-за отсутствия делящихся клеток.

Возможные результаты

Хромосомная аномалия выявлена

Такой результат указывает, что в исследованном материале обнаружено изменение количества одной или нескольких хромосом. Выявленная аномалия могла быть причиной остановки развития эмбриона и потери беременности.

Большинство анеуплоидий возникает случайно. Однако в отдельных ситуациях врач может рекомендовать консультацию генетика, исследование кариотипа супругов или другие дополнительные обследования.

Хромосомная аномалия не выявлена

Нормальный результат означает, что исследование не обнаружило численных нарушений хромосом в пределах разрешающей способности метода. При этом он не исключает другие возможные причины потери беременности, включая точечные генетические варианты, отдельные структурные перестройки, эпигенетические нарушения, а также анатомические, гормональные, инфекционные, иммунологические и другие факторы.

Неинформативный результат

В некоторых случаях получить достоверный результат невозможно. Причиной может быть недостаточное количество материала, низкое качество или разрушение ДНК, выраженное загрязнение материнскими клетками либо отсутствие пригодных для анализа тканей.

Ограничения исследования

Тест предназначен преимущественно для определения численных нарушений хромосом. Тест может не выявлять:

• точечные мутации в отдельных генах;
• большинство наследственных моногенных заболеваний;
• сбалансированные транслокации и инверсии;
• небольшие делеции и дупликации ниже разрешающей способности метода;
• низкоуровневый мозаицизм;

Подготовка к исследованию

Специальная подготовка пациента не требуется. Основное значение имеют правильный забор, маркировка, хранение и транспортировка биоматериала.

Интерпретация результата

Обнаружение хромосомной аномалии помогает объяснить конкретную потерю беременности, но не всегда позволяет точно определить индивидуальный риск её повторения.

Отсутствие выявленных анеуплоидий также не исключает другие причины невынашивания беременности и при наличии показаний может потребовать дополнительного обследования.