Аналіз абортивного матеріалу на анеуплоідії по всіx 24 хромосомах (NGS)

Генетичне дослідження абортивного матеріалу методом високопродуктивного секвенування нового покоління — NGS (Next Generation Sequencing) — проводиться для виявлення числових порушень хромосом, які могли стати причиною самовільного переривання або вагітності, що не розвивається.

У межах тесту аналізуються всі хромосоми людини: 22 пари аутосом і статеві хромосоми X та Y. Дослідження дає змогу визначити наявність зайвої або відсутньої хромосоми, а також низки інших змін кількості хромосомного матеріалу.

Для чого проводиться дослідження

Значна частина втрат вагітності на ранніх термінах пов’язана з випадковими хромосомними порушеннями в ембріона. Такі зміни можуть виникати під час формування статевих клітин або на ранніх етапах розвитку ембріона та зазвичай не залежать від способу життя жінки.

Аналіз абортивного матеріалу допомагає встановити, чи була втрата вагітності пов’язана з числовою хромосомною аномалією. Отримана інформація може бути корисною для визначення подальшої тактики обстеження пари, оцінки репродуктивних ризиків і підготовки до наступної вагітності.

Що показує аналіз

• трисомії — наявність додаткової копії однієї з хромосом;
• моносомії — відсутність однієї копії хромосоми;
• анеуплоїдії статевих хромосом X та Y;
• поєднані числові порушення кількох хромосом;
• поліплоїдії — зміна кількості повних наборів хромосом, якщо їх виявлення передбачене тест-системою, що використовується;
• мозаїчні хромосомні зміни — за достатньої частки змінених клітин і наявності відповідної технічної валідації методу.

Показання до проведення тесту

• самовільне переривання вагітності;
• вагітність, що не розвивається, або завмерла вагітність;
• анембріонія;
• звичне невиношування вагітності;
• повторні репродуктивні втрати;
• необхідність уточнення можливої причини втрати вагітності;
• планування наступної вагітності та визначення показань до консультації лікаря-генетика.

Як проводиться дослідження

Із наданого біологічного матеріалу виділяють ДНК. Після оцінки її кількості та якості проводять підготовку генетичної бібліотеки та високопродуктивне секвенування. Отримані дані обробляють за допомогою спеціалізованих біоінформатичних програм, які оцінюють кількість генетичного матеріалу кожної хромосоми.

На підставі аналізу формується лабораторний висновок, у якому зазначається, чи виявлено числові хромосомні порушення та які саме хромосоми вони стосуються.

Для аналізу можуть використовуватися тканини плідного яйця або інші фрагменти абортивного матеріалу.

Умови зберігання та транспортування біоматеріалу

• Ми не здійснюємо забір матеріалу. Матеріал відбирається лікарем-гінекологом під контролем УЗД та направляється до нас.
• Для дослідження використовують тканини плода. Для мінімізації ризику контамінації материнськими клітинами рекомендується, за можливості, виділяти тканини плода, уникаючи включення великої кількості тканин ендометрію та згустків крові.
• Матеріал поміщають у стерильний контейнер із фізіологічним розчином (0,9% NaCl).
• Не допускається фіксація матеріалу у формаліні, оскільки це призводить до пошкодження ДНК і робить проведення аналізу методом NGS неможливим.
• До відправлення в лабораторію зразок слід зберігати за температури +2…+8 °C.
• Рекомендується доставити матеріал до лабораторії протягом 24–48 годин після отримання.
• Якщо доставка у зазначений термін неможлива, матеріал допускається заморозити за температури −20 °C. Слід уникати повторних циклів заморожування та розморожування.
• Не допускаються висихання зразка, тривале зберігання за кімнатної температури та забруднення сторонніми тканинами.

Переваги методу NGS

• одночасний аналіз усіх 24 хромосом;
• висока аналітична чутливість і відтворюваність;
• не потребує вирощування клітинної культури;
• можливість проведення дослідження на невеликій кількості біологічного матеріалу за умови достатньої якості ДНК;
• ширший обсяг аналізу порівняно з методами, спрямованими лише на окремі хромосоми;
• можливість отримання результату навіть у випадках, коли стандартне каріотипування ускладнене через відсутність клітин, що діляться.

Можливі результати

Хромосомну аномалію виявлено

Такий результат свідчить про те, що в дослідженому матеріалі виявлено зміну кількості однієї або кількох хромосом. Виявлена аномалія могла бути причиною припинення розвитку ембріона та втрати вагітності.

Більшість анеуплоїдій виникають випадково. Однак в окремих ситуаціях лікар може рекомендувати консультацію генетика, дослідження каріотипу подружжя або інші додаткові обстеження.

Хромосомну аномалію не виявлено

Нормальний результат означає, що дослідження не виявило числових порушень хромосом у межах роздільної здатності методу. Водночас такий результат не виключає інших можливих причин втрати вагітності, зокрема точкових генетичних варіантів, окремих структурних перебудов, епігенетичних порушень, а також анатомічних, гормональних, інфекційних, імунологічних та інших факторів.

Неінформативний результат

У деяких випадках отримати достовірний результат неможливо. Причиною може бути недостатня кількість матеріалу, низька якість або деградація ДНК, значна контамінація материнськими клітинами або відсутність тканин, придатних для аналізу.

Обмеження дослідження

Тест призначений переважно для визначення числових порушень хромосом. Тест може не виявляти:

• точкові мутації в окремих генах;
• більшість спадкових моногенних захворювань;
• збалансовані транслокації та інверсії;
• невеликі делеції та дуплікації нижче роздільної здатності методу;
• низькорівневий мозаїцизм.

Підготовка до дослідження

Спеціальна підготовка пацієнта не потрібна. Основне значення мають правильний забір, маркування, зберігання та транспортування біоматеріалу.

Інтерпретація результату

Виявлення хромосомної аномалії допомагає пояснити конкретну втрату вагітності, але не завжди дає змогу точно визначити індивідуальний ризик її повторення.

Відсутність виявлених анеуплоїдій також не виключає інших причин невиношування вагітності та за наявності показань може потребувати додаткового обстеження.