Микробиом полости рта, методом NGS

Исследование микробиоты полости рта методом секвенирования нового поколения (NGS, Next Generation Sequencing) представляет собой современный молекулярно-генетический анализ, позволяющий определить состав бактериального сообщества полости рта с высокой точностью. В отличие от классического бактериологического посева, который выявляет лишь ограниченный круг микроорганизмов и зависит от условий культивирования, технология NGS одновременно анализирует десятки и сотни видов бактерий, включая трудно культивируемые микроорганизмы.

Микробиом полости рта играет важную роль в поддержании здоровья зубов, десен и слизистой оболочки. Нарушение его баланса (дисбиоз) связано с развитием кариеса, гингивита, пародонтита, периимплантита, неприятного запаха изо рта, воспалительных процессов, а также рассматривается как один из факторов, влияющих на общее состояние организма.

Исследование позволяет оценить не только наличие отдельных бактерий, но и структуру всего микробного сообщества, определить баланс между защитной и патогенной микрофлорой, выявить признаки воспалительных процессов и получить персонализированные рекомендации для пациента и лечащего врача.

Что анализируется

В ходе исследования проводится секвенирование участка гена 16S рРНК, который является международным стандартом идентификации бактерий. Полученные последовательности сравниваются со специализированной базой данных микроорганизмов полости рта, что позволяет определить относительное содержание различных видов бактерий и оценить состояние микробиома.

• бактериальный состав микробиоты полости рта;
• общее микробное разнообразие;
• баланс защитной и патогенной микрофлоры;
• уровень дисбиоза;
• преобладающие бактериальные сообщества;
• относительное содержание основных микроорганизмов;
• клинически значимые патогены.

Какие показатели включает отчет

• Общая характеристика микробиома полости рта.
• Количество выявленных бактериальных родов и видов.
• Оценка микробного разнообразия.
• Распределение микроорганизмов по основным типам (Phylum).
• Баланс защитной, нейтральной, провоспалительной и патогенной микрофлоры.
• Определение наиболее распространенных микроорганизмов с указанием их относительного содержания.
• Топ наиболее представленных бактерий образца.
• Степень достоверности идентификации каждого микроорганизма.

Оценка риска стоматологических заболеваний

Полученные данные автоматически анализируются с использованием современных клинических алгоритмов, что позволяет оценить вероятность развития наиболее распространенных заболеваний полости рта.

• риск развития пародонтита;
• наличие бактерий красного и оранжевого комплексов Socransky;
• риск развития кариеса;
• наличие кариес-ассоциированных микроорганизмов;
• оценка риска периимплантита;
• выявление признаков воспалительных процессов десен;
• оценка общего уровня патогенной нагрузки.

Комплексы Socransky

В отчете проводится анализ бактерий согласно международной классификации Socransky, которая широко используется в современной пародонтологии. Все обнаруженные микроорганизмы распределяются по комплексам в зависимости от их патогенного потенциала.

• Красный комплекс — микроорганизмы, наиболее тесно связанные с активным пародонтитом.
• Оранжевый комплекс — бактерии, способствующие развитию воспаления и колонизации тканей пародонтопатогенами.
• Желтый, зеленый и фиолетовый комплексы — преимущественно представители нормальной защитной микрофлоры.

По каждому комплексу рассчитывается суммарная доля микроорганизмов и автоматически определяется уровень риска.

GF-MOR профиль

Дополнительно выполняется оценка микробного профиля по современной системе GF-MOR, позволяющей определить наиболее вероятное состояние микробиома. Система анализирует совокупность микроорганизмов и определяет, какой клинической картине соответствует полученный профиль.

Такой анализ помогает врачу быстрее интерпретировать результаты исследования и оценить вероятность воспалительных процессов даже при отсутствии выраженных клинических симптомов.

Кариес-маркеры

Отдельный раздел отчета посвящен бактериям, ассоциированным с развитием кариеса. Исследование позволяет выявить микроорганизмы, принимающие участие в образовании зубного налета, деминерализации эмали и прогрессировании кариозного процесса.

Полученная информация помогает оценить индивидуальный риск развития кариеса и подобрать оптимальные профилактические мероприятия.

Пародонтологический риск

Исследование определяет наличие ключевых пародонтопатогенов, ответственных за развитие хронического воспаления тканей пародонта. При повышенном содержании данных микроорганизмов врач получает объективные основания для проведения дополнительного обследования и своевременного лечения.

Периимплантит

У пациентов с установленными дентальными имплантатами исследование позволяет выявить микроорганизмы, ассоциированные с воспалением тканей вокруг импланта. Это может использоваться как для диагностики осложнений, так и для контроля эффективности лечения.

Oral-Gut Axis

Современные исследования показывают, что отдельные представители микробиоты полости рта способны попадать в желудочно-кишечный тракт и участвовать в формировании системных воспалительных процессов. В отчете оценивается наличие бактерий, потенциально связанных с транслокацией из полости рта в кишечник, что представляет интерес как для стоматологов, так и для специалистов превентивной медицины.

Персонализированные рекомендации

На основании результатов исследования формируются рекомендации, которые могут включать необходимость консультации пародонтолога, стоматолога-терапевта, имплантолога или других специалистов. При необходимости могут быть рекомендованы профессиональная гигиена полости рта, дополнительные диагностические исследования, контроль состояния десен, профилактические мероприятия и другие лечебно-профилактические подходы.

Кому рекомендуется исследование

• пациентам с кровоточивостью десен;
• при хроническом гингивите;
• при пародонтите;
• при неприятном запахе изо рта;
• при частых воспалительных заболеваниях полости рта;
• при множественном кариесе;
• перед имплантацией зубов;
• после имплантации для оценки риска осложнений;
• перед ортодонтическим лечением;
• после длительной антибиотикотерапии;
• для оценки эффективности лечения заболеваний пародонта;
• в рамках профилактического обследования.

Для каких специалистов предназначен отчет

• стоматологов-терапевтов;
• пародонтологов;
• имплантологов;
• ортодонтов;
• стоматологов-хирургов;
• гигиенистов;
• семейных врачей;
• врачей превентивной медицины;
• гастроэнтерологов (при комплексной оценке состояния пациента).

Преимущества исследования

• Высокая точность идентификации микроорганизмов благодаря технологии NGS.
• Комплексный анализ микробиома вместо поиска отдельных бактерий.
• Выявление более широкого спектра микроорганизмов по сравнению с традиционным бактериологическим посевом.
• Оценка микробного разнообразия.
• Выявление дисбиотических изменений.
• Определение баланса защитной и патогенной микрофлоры.
• Расчет пародонтологического риска.
• Выявление кариес-маркеров.
• Оценка риска периимплантита.
• Анализ Oral-Gut Axis.
• Использование международной классификации Socransky.
• Современная классификация GF-MOR.
• Наглядные графики и диаграммы.
• Подробная клиническая интерпретация результатов.
• Персонализированные рекомендации для врача и пациента.

Образец результата

По результатам исследования выдается современный многостраничный отчет, содержащий подробную информацию о составе микробиоты полости рта, уровне микробного разнообразия, соотношении защитных и патогенных бактерий, наиболее значимых микроорганизмах, оценке риска развития стоматологических заболеваний, клинической интерпретации полученных данных и рекомендациях по дальнейшему обследованию и лечению.