Мікробіом ротової порожнини, методом NGS

Дослідження мікробіоти порожнини рота методом секвенування нового покоління (NGS, Next Generation Sequencing) є сучасним молекулярно-генетичним аналізом, який дозволяє з високою точністю визначити склад бактеріальної спільноти порожнини рота. На відміну від класичного бактеріологічного посіву, що виявляє лише обмежене коло мікроорганізмів і залежить від умов культивування, технологія NGS одночасно аналізує десятки й сотні видів бактерій, включаючи мікроорганізми, які важко культивуються.

Мікробіом порожнини рота відіграє важливу роль у підтриманні здоров'я зубів, ясен і слизової оболонки. Порушення його балансу (дисбіоз) пов'язане з розвитком карієсу, гінгівіту, пародонтиту, періімплантиту, неприємного запаху з рота, запальних процесів, а також розглядається як один із чинників, що впливає на загальний стан організму.

Дослідження дозволяє оцінити не лише наявність окремих бактерій, а й структуру всієї мікробної спільноти, визначити баланс між захисною та патогенною мікрофлорою, виявити ознаки запальних процесів і надати персоналізовані рекомендації для пацієнта та лікаря.

Що аналізується

Під час дослідження виконується секвенування ділянки гена 16S рРНК, який є міжнародним стандартом ідентифікації бактерій. Отримані послідовності порівнюються зі спеціалізованою базою даних мікроорганізмів порожнини рота, що дозволяє визначити відносний вміст різних видів бактерій та оцінити стан мікробіому.

• бактеріальний склад мікробіоти порожнини рота;
• загальне мікробне різноманіття;
• баланс захисної та патогенної мікрофлори;
• рівень дисбіозу;
• переважаючі бактеріальні спільноти;
• відносний вміст основних мікроорганізмів;
• клінічно значущі патогени.

Які показники містить звіт

• Загальна характеристика мікробіому порожнини рота.
• Кількість виявлених бактеріальних родів і видів.
• Оцінка мікробного різноманіття.
• Розподіл мікроорганізмів за основними типами (Phylum).
• Баланс захисної, нейтральної, прозапальної та патогенної мікрофлори.
• Визначення найпоширеніших мікроорганізмів із зазначенням їхнього відносного вмісту.
• Топ найбільш представлених бактерій у зразку.
• Ступінь достовірності ідентифікації кожного мікроорганізму.

Оцінка ризику стоматологічних захворювань

Отримані дані автоматично аналізуються з використанням сучасних клінічних алгоритмів, що дозволяє оцінити ймовірність розвитку найпоширеніших захворювань порожнини рота.

• ризик розвитку пародонтиту;
• наявність бактерій червоного та помаранчевого комплексів Socransky;
• ризик розвитку карієсу;
• наявність карієс-асоційованих мікроорганізмів;
• оцінка ризику періімплантиту;
• виявлення ознак запальних процесів ясен;
• оцінка загального рівня патогенного навантаження.

Комплекси Socransky

У звіті проводиться аналіз бактерій відповідно до міжнародної класифікації Socransky, яка широко використовується в сучасній пародонтології. Усі виявлені мікроорганізми розподіляються за комплексами залежно від їхнього патогенного потенціалу.

• Червоний комплекс — мікроорганізми, які найбільш тісно пов'язані з активним пародонтитом.
• Помаранчевий комплекс — бактерії, що сприяють розвитку запалення та колонізації тканин пародонтопатогенами.
• Жовтий, зелений і фіолетовий комплекси — переважно представники нормальної захисної мікрофлори.

Для кожного комплексу розраховується сумарна частка мікроорганізмів і автоматично визначається рівень ризику.

GF-MOR профіль

Додатково виконується оцінка мікробного профілю за сучасною системою GF-MOR, яка дозволяє визначити найбільш імовірний стан мікробіому. Система аналізує сукупність мікроорганізмів і визначає, якій клінічній картині відповідає отриманий профіль.

Такий аналіз допомагає лікарю швидше інтерпретувати результати дослідження та оцінити ймовірність запальних процесів навіть за відсутності виражених клінічних симптомів.

Карієс-маркери

Окремий розділ звіту присвячений бактеріям, асоційованим із розвитком карієсу. Дослідження дозволяє виявити мікроорганізми, що беруть участь в утворенні зубного нальоту, демінералізації емалі та прогресуванні каріозного процесу.

Отримана інформація допомагає оцінити індивідуальний ризик розвитку карієсу та підібрати оптимальні профілактичні заходи.

Пародонтологічний ризик

Дослідження визначає наявність ключових пародонтопатогенів, відповідальних за розвиток хронічного запалення тканин пародонта. За підвищеного вмісту цих мікроорганізмів лікар отримує об'єктивні підстави для проведення додаткового обстеження та своєчасного лікування.

Періімплантит

У пацієнтів із встановленими дентальними імплантатами дослідження дозволяє виявити мікроорганізми, асоційовані із запаленням тканин навколо імплантата. Це може використовуватися як для діагностики ускладнень, так і для контролю ефективності лікування.

Oral-Gut Axis

Сучасні дослідження свідчать, що окремі представники мікробіоти порожнини рота здатні потрапляти до шлунково-кишкового тракту та брати участь у формуванні системних запальних процесів. У звіті оцінюється наявність бактерій, потенційно пов'язаних із транслокацією з порожнини рота до кишечника, що становить інтерес як для стоматологів, так і для фахівців превентивної медицини.

Персоналізовані рекомендації

На підставі результатів дослідження формуються рекомендації, які можуть включати необхідність консультації пародонтолога, стоматолога-терапевта, імплантолога або інших спеціалістів. За потреби можуть бути рекомендовані професійна гігієна порожнини рота, додаткові діагностичні дослідження, контроль стану ясен, профілактичні заходи та інші лікувально-профілактичні підходи.

Кому рекомендоване дослідження

• пацієнтам із кровоточивістю ясен;
• при хронічному гінгівіті;
• при пародонтиті;
• при неприємному запаху з рота;
• при частих запальних захворюваннях порожнини рота;
• при множинному карієсі;
• перед імплантацією зубів;
• після імплантації для оцінки ризику ускладнень;
• перед ортодонтичним лікуванням;
• після тривалої антибіотикотерапії;
• для оцінки ефективності лікування захворювань пародонта;
• у межах профілактичного обстеження.

Для яких спеціалістів призначений звіт

• стоматологів-терапевтів;
• пародонтологів;
• імплантологів;
• ортодонтів;
• стоматологів-хірургів;
• гігієністів;
• сімейних лікарів;
• лікарів превентивної медицини;
• гастроентерологів (при комплексній оцінці стану пацієнта).

Переваги дослідження

• Висока точність ідентифікації мікроорганізмів завдяки технології NGS.
• Комплексний аналіз мікробіому замість пошуку окремих бактерій.
• Виявлення ширшого спектра мікроорганізмів порівняно з традиційним бактеріологічним посівом.
• Оцінка мікробного різноманіття.
• Виявлення дисбіотичних змін.
• Визначення балансу захисної та патогенної мікрофлори.
• Розрахунок пародонтологічного ризику.
• Виявлення карієс-маркерів.
• Оцінка ризику періімплантиту.
• Аналіз Oral-Gut Axis.
• Використання міжнародної класифікації Socransky.
• Сучасна класифікація GF-MOR.
• Наочні графіки та діаграми.
• Детальна клінічна інтерпретація результатів.
• Персоналізовані рекомендації для лікаря та пацієнта.

Зразок результату

За результатами дослідження видається сучасний багатосторінковий звіт, що містить детальну інформацію про склад мікробіоти порожнини рота, рівень мікробного різноманіття, співвідношення захисних і патогенних бактерій, найбільш значущі мікроорганізми, оцінку ризику розвитку стоматологічних захворювань, клінічну інтерпретацію отриманих даних і рекомендації щодо подальшого обстеження та лікування.