Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель "Бічний Аміотрофічний Склероз (БАС)" входить 35 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій (ХМА).
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на Бічний Аміотрофічний Склероз (БАС).
У цій панелі не розглядається розширення гексануклеотидного повтору в області, що не кодує C9orf72. Це окремий тест, який краще робити перед даною панеллю, тому що він відповідає за 40% випадків БАС, детальніше Аналіз повторів області C9orf72.
Бічний аміотрофічний склероз (БАС) — прогресуюче нейродегенеративне захворювання, що характеризується вибірковою загибеллю рухових нейронів у моторній корі, стовбурі головного та спинного мозку. Дисфункція та втрата цих нейронів призводить до м'язової слабкості, атрофії та, зрештою, до паралічу кінцівок, бульбарних та дихальних м'язів. Поширеність БАС становить 1-9 випадків на 100 000 осіб. Більшість БАС виникає у людей без сімейної історії БАС. Сімейний БАС найчастіше успадковується за аутосомно-домінантним типом. Рідше він може успадковуватись за аутосомно-рецесивним або Х-зчепленим типом.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
ALS2 | Бічний аміотрофічний склероз, Спастичний параліч | AR | 33 | 68 |
ANG | Бічний аміотрофічний склероз | AD | 8 | 37 |
ATL1 | Спастична параплегія, нейропатія, спадкова сенсорна | AD | 29 | 84 |
BSCL2 | Ліподистрофія, вроджена генералізована, Енцефалопатія, прогресуюча, Нейропатія, дистальна спадкова моторна, тип VA, Хвороба Шарко-Марі-Тута 2 тип, Синдром Сільвера, Синдром спастичної параплегії Сільвера, Спастична параплегія | AD/AR | 34 | 50 |
CHCHD10 | Міопатія, ізольована мітохондріальна, лобово-скронева деменція та/або бічний аміотрофічний склероз 2, спинальна м'язова атрофія, тип Джокела | AD | 4 | 26 |
CHMP2B | Бічний аміотрофічний склероз, пов'язаний з CHMP2B, лобово-скронева деменція | AD | 6 | 21 |
DCTN1 | Синдром Перрі, невропатія, дистальний спадковий моторний | AD | 10 | 52 |
FIG4 | Бічний аміотрофічний склероз, полімікрогірія, двостороння потилична, синдром Юніса-Варона, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 34 | 69 |
FUS | Бічний аміотрофічний склероз, Есенційний тремор | AD/AR | 22 | 111 |
GBE1 | Хвороба накопичення глікогену | AR | 36 | 70 |
GRN | Лобно-скронева пайова дегенерація з включеннями TDP43, пов'язана з GRN, нейрональний цероїдний ліпофусциноз | AD/AR | 43 | 214 |
HEXA | Хвороба Тея-Сакса, GM2-гангліозидоз, дефіцит гексозамінідази А | AR | 128 | 194 |
HNRNPA1 | Бічний аміотрофічний склероз, міопатія з тільцями включення з раннім початком хвороби Педжету | AD | 20 | 11 |
HSPD1 | Спастична параплегія, лейкодистрофія, гіпомієлінізуюча | AD/AR | 5 | 5 |
KIAA0196 | Спастична параплегія, синдром Річера-Шинцеля (синдром 3С) | AD/AR | 15 | 18 |
KIF5A | Спастична параплегія | AD | 18 | 62 |
MATR3 | Бічний аміотрофічний склероз 21 | AD | 4 | 16 |
OPTN | Глаукома, відкритокутова, Глаукома, нормотензія, Бічний аміотрофічний склероз 12 | AD | 13 | 61 |
PFN1 | Бічний аміотрофічний склероз 18 | AD | 5 | 8 |
PRF1 | Лімфома, неходжкінська, апластична анемія, початок у дорослих, гемофагоцитарний лімфогістіоцитоз | AR | 24 | 183 |
REEP1 | Спастична параплегія, Дистальна спадкова моторна нейронопатія | AD | 16 | 60 |
SETX | Атаксія з окорухової апраксією, Бічний аміотрофічний склероз, Ювенільна, Спіноцеребеллярна атаксія | AD/AR | 36 | 210 |
SLC52A2 | Синдром Брауна-Віалетто-Ван Лаєра | AR | 27 | 25 |
SLC52A3 | Хвороба Фаціо-Лонде, синдром Брауна-Віалетто-Ван Лаера | AR | 30 | 42 |
SOD1 | Бічний аміотрофічний склероз, кератоконус | AD/AR | 40 | 215 |
SPAST | Спастична параплегія | AD | 193 | 723 |
SPG11 | Спастична параплегія, Бічний аміотрофічний склероз, Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 162 | 274 |
SPG20 | Спастична параплегія (синдром Троєра) | AR | 9 | 7 |
SQSTM1 | Хвороба Педжета кістки, лобово-скронева деменція та/або бічний аміотрофічний склероз 3, міопатія дистальна, з ободковими вакуолями, нейродегенерація з атаксією, дистонією та паралічем погляду, початок у дитячому віці | AD/AR | 10 | 97 |
TARDBP | Бічний аміотрофічний склероз | AD | 20 | 69 |
TIA1 | Дистальна міопатія Веландера | AD | 1 | 13 |
TUBA4A | Бічний аміотрофічний склероз 22 | AD | 6 | 13 |
UBQLN2 | Бічний аміотрофічний склероз | XL | 5 | 31 |
VAPB | Бічний аміотрофічний склероз, Спинальна м'язова атрофія, пізній початок, Фінкель | AD | 2 | 9 |
VCP | Бічний аміотрофічний склероз, міопатія з тільцями включення з раннім початком хвороби Педжета, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 17 | 61 |
* Тип успадкованийія: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз вияв варіанти, які є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна безкоштовно отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Вимоги здачі крові натще немає (легкий сніданок і незадовго до взяття крові випити 1-2 склянки звичайної негазованої води; дітей обов'язково напувати негазованою водою порціями, до 150-200 мл, протягом 30 хвилин), в день здачі крові не вживати медикаменти (включаючи вітаміни та БАД), напередодні виключити прийом смаженої та жирної їжі, виключити за 32 години алкоголь.
Проводиться забір венозної крові у пробірку з ЕДТА 4 мл.
Необхідно надати (взяти з собою або надіслати нам на електронну пошту) висновок лікаря з детальною клінічною картиною (опис симтомів, діагноз/попередній діагноз) та фото досліджуваного пацієнта (якщо є фенотипно значущі особливості), заповнити в електронному вигляді анкету.
У всіх випадках за результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.