Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Брахідактилія / Синдактилія входить 21 ген, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на Брахідактилію або Синдактилію. Гени на цій панелі включені в Розширена панель кісткових дисплазій та порушень.
Панель брахідактилії/синдактилії включає гени, пов'язані з ізольованими формами брахідактилії та синдактилії, а також деякі синдромальні форми, такі як синдром брахідактилії-синдактилії, викликаний мутаціями в гені HOXD13, і долонно-підошвенний ген.
Брахідактилія («короткі пальці») відноситься до непропорційно коротким пальцям рук і ніг і є частиною групи вад розвитку кінцівок, що характеризуються кістковим дизостозом. Різні типи ізольованої брахідактилії зустрічаються рідко, крім типів D і A3, коли основна генетична причина невідома. На сьогоднішній день виявлено безліч різних форм брахідактилії. Деякі форми також призводять до низькорослості. При ізольованій брахідактилі зміни можуть бути присутні в інших місцях. Брахідактилія може супроводжуватися іншими вадами розвитку рук, такими як синдактилія, полідактилія, редукційні дефекти або симфалангізм.
Синдактилія є однією з найпоширеніших спадкових вад розвитку кінцівок, що призводять до злиття певних пальців рук та/або ніг. Це може відбуватися як ізольована риса або частина синдрому. Як брахідактилії, так і синдактилії демонструють велику між- та внутрішньосімейну клінічну мінливість зі зниженою пенетрантністю. Синдром Робертса, зумовлений мутаціями гена ESCO2, характеризується пре- та постнатальною затримкою росту, важкими симетричними дефектами редукції кінцівок, черепно-лицьовими аномаліями та тяжкою розумовою відсталістю. SC фокомелія є легшою формою RBS. Мутації RECQL4 пов'язані з RAPADILINO, синдромом Ротмунда-Томсона (RTS) та синдромом Баллера-Герольда. Мутації TP63 відповідальні за порок розвитку з розщепленим пензлем/розщепленою стопою, синдром, що зачіпає центральні промені аутопода і проявляється синдактилією, серединними ущелинами кистей і стоп, аплазією та/або гіпоплазією фаланг, п'ясткових і плюсневих кісток.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
BMP2 | Брахідактилія типу А2 | AD | 5 | 28 |
BMPR1B | Акромесомальна дисплазія, Демірхан, Брахідактилія С/симфалангізмоподібний фенотип, Брахідактилія типу А2, Легенева артеріальна гіпертензія (ЛАГ) | AD/AR | 12 | 23 |
CHSY1 | Синдром темтами преаксіальної брахідактилії | AR | 6 | 16 |
DHCR7 | Синдром Сміта-Лемлі-Опіца | AR | 88 | 217 |
ESCO2 | Синдром СК фокомелії, синдром Робертса | AR | 30 | 31 |
FAM58A | Синдактилія пальців стопи, телекантус, аногенітальні та ниркові вади розвитку (синдром STAR) | XL | 8 | 11 |
GDF5 | Синдром множинних синостозів, малогомілкова гіпоплазія та складна брахідактилія типу А2 | AD/AR | 23 | 53 |
GNAS | синдром МакКьюна-Олбрайта, прогресуюча кісткова гетероплазія, псевдогіпопаратиреоз, спадкова остеодистрофія Олбрайта | AD | 64 | 274 | Синдром брахідактилії-синдактилії, Синополідактилія, Синдактилія, Синополідактилія з розщепленням, Брахідактилія типу D | AD/AR | 18 | 41 |
IHH | Акрокапітофеморальна дисплазія, брахідактилія, синдактилія за типом Люкена | AD/AR | 12 | 32 |
MYCN | Синдром Фейнгольда | AD | 27 | 41 |
NOG | Синдром передплюсне-зап'ясткової коаліції, синдром множинних синостозів, анкілоз стремена з широкими пальцями рук і ніг (синдром Тейніссена-Кремерса), симфалангізм, проксимальний, брахідактилія типу B2 | AD | 20 | 63 |
PDE3A | Гіпертонія з брахідактилією | AD | 7 | 10 |
PDE4D | Акродізостоз 2, з гормонорезистентністю або без неї | AD | 15 | 38 |
PTDSS1 | Гіперостотична карликовість Ленца-Маєвського | AD | 5 | 7 |
PTHLH | Брахідактилія, тип E2 | AD | 5 | 18 |
RECQL4 | синдром Баллера-Герольда, синдром РАПАДІЛІНО, синдром Ротмунда-Томсона | AR | 82 | 114 |
ROR2 | Синдром Робінова рецесивний тип, брахідактилія типу В | AD/AR | 21 | 40 |
SOX9 | Кампомелічна дисплазія, зміна статі 46,XY, брахідактилія з аноніхією (синдром Кука) | AD | 47 | 144 |
TP63 | Синдром Раппа-Ходжкіна, Орофаціальна ущелина, Дорослий синдром, Ектродактилія, ектодермальна дисплазія та синдром ущелини губи/піднебіння, Анкілоблефарон-ектодермальні дефекти-заяча губа/піднебіння, Розщеплена-> | AD | 59 | 122 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз вияв варіанти, які є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна безкоштовно отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Вимоги здачі крові натще немає (легкий сніданок і незадовго до взяття крові випити 1-2 склянки звичайної негазованої води; дітей обов'язково напувати негазованою водою порціями, до 150-200 мл, протягом 30 хвилин), в день здачі крові не вживати медикаменти (включаючи вітаміни та БАД), напередодні виключити прийом смаженої та жирної їжі, виключити за 32 години алкоголь.
Проводиться забір венозної крові у пробірку з ЕДТА 4 мл.
Необхідно надати (взяти з собою або надіслати нам на електронну пошту) висновок лікаря з детальною клінічною картиною (опис симтомів, діагноз/попередній діагноз) та фото досліджуваного пацієнта (якщо є фенотипно значущі особливості), заповнити в електронному вигляді анкету.
У всіх випадках за результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.