Панель гемолітико-уремічний синдром

В панель Гемолитико-уремический синдром входит 9 генов, также включена оценка некодирующих вариантов, обнаружение делеций и дупликаций.

Идеальная панель для пациентов с клиническим подозрением на гемолитико-уремический синдром или родственное заболевания.

Гемолитико-уремический синдром (HUS) характеризуется гемолитической анемией, тромбоцитопенией и нарушением функции почек. Атипичный HUS (aHUS) является генетическим, тогда как типичный HUS вызывается инфекционными агентами, а не генетической предрасположенностью. Возраст начала аГУС варьируется от внутриутробного до взрослого. Пациенты с семейной формой аГУС имеют плохой прогноз: частота терминальной стадии заболевания почек или смерти составляет от 50 до 80% (PMID: 19846853). У лиц с генетическим атипичным гемолитико-уремическим синдромом часто наблюдается рецидив даже после полного выздоровления после данного эпизода. Шестьдесят процентов генетических аГУС переходят в ТХПН. Мутации CFH составляют примерно 30% случаев, CD46 - 12%, CFI - 5-10%, C3 - 5% и THBD.за 3%-5%. При aHUS с ранним началом, определяемом как начало заболевания в возрасте до 1 года, мутации в DGKE объясняют 27% случаев. Предрасположенность к aHUS наследуется по аутосомно-рецессивному или аутосомно-доминантному типу с неполной пенетрантностью. Лечение можно оптимизировать с помощью генетического тестирования. Следует избегать трансплантации живой почки от родственных лиц, поскольку они также могут подвергаться повышенному генетическому риску заболевания. Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что исход трансплантации почки благоприятный у пациентов с мутациями CD46 и DGKE , но не у пациентов с CFH , CFI , C3 , THBD или CFB мутацией; однако одновременная трансплантация почки и печени детям раннего возраста с aHUS и CFH мутацией может исправить генетический дефект и предотвратить рецидив заболевания. ДРУГАЯ ИНФОРМАЦИЯ О ГЕНАХ CFH И CFHR1-4

Ген CFH имеет несколько псевдогенных экзонов (экзоны 8–9, 11, 21–23). Более того, функция CFHR1, CFHR2, CFHR3 и CFHR4 не установлена, и они являются в высокой степени гомологами (см. ниже главу «Гены CFHR1-4»).

Генетика атипического гемолитико-уремического синдрома (aHUS) Мутации CFH составляют примерно 30% случаев, CD46 (также известный как MCP) — 12%, CFI — 5–10%, C3 — 5%, THBD — 3–5%. При aHUS с ранним началом (заболевание проявляется в возрасте до 1 года) мутации в DGKE объясняют 27% случаев. Тип наследования трудно определить для большинства генов, связанных с aHUS, из-за низкой пенетрантности, но предрасположенность к заболеванию обычно является аутосомно-доминантной. В базе данных мутаций ClinVar подавляющее большинство связанных с новым заболеванием вариантов основных генов aHUS, таких как CFH, CD46, CFI и C3, классифицируются как факторы риска, но не являются патогенными или вероятно патогенными. В большинстве семей, где у пробандов имеется новый вариант гена aHUS, некоторые из здоровых родителей или других членов семьи являются носителями того же варианта. Однако, одно исследование показало полностью пенетрантный рецессивный aHUS, связанный с гомозиготными мутациями CFH, у крупной бедуинской родословной с 10 случаями aHUS (PubMed: 9811382). Кроме того, было показано, что делеции генов от CFHR1 до CFHR5 несколько увеличивают риск аГУС. Группа из 66 пациентов с аГУС в Ньюкасле показала, что делеции в CFHR1 чаще встречались у пациентов с аГУС по сравнению с контрольной группой (ноль копий 10% против 2%; одна копия 35% против 9% и две копии 55% против 89%), что указывает на отношение шансов. (OR) 6,3 для гомозиготной делеции и 3,8 для гетерозиготной. Было показано, что отсутствие CFHR1 и/или CFHR3 способствует дефектной регуляции активации комплемента на поверхностях клеток и тканей (PubMed: 17367211). Hofer и соавт. обследовали 116 пациентов с аГУС и 118 пациентов из контрольной группы. Гомозиготная делеция CFHR1 была обнаружена у 32% протестированных пациентов с аГУС и у 2,5% контрольной группы. Антитела к CFH присутствовали у 25% пациентов и ни у одного из контрольной группы. Антитела к CFH были обнаружены у 82% пациентов с гомозиготной делецией CFHR1 и у 6% пациентов без нее. У CFH-антитело-положительных пациентов с aHUS наблюдался значительно более низкий уровень тромбоцитов в начале заболевания и значительно менее частое поражение центральной нервной системы, чем у антител-отрицательных пациентов. Пациенты с положительным результатом на антитела также чаще получали плазмотерапию (PubMed: 23243267). Примечательно, что активность заболевания, по-видимому, лучше коррелирует с титром иммунных комплексов, чем с титром FHAA (PubMed: 22922817). В 2016 году Чаллис и др. описали новый гибридный ген CFH/CFHR3 у пациента с aHUS, вторичным по отношению к делеции de novo размером 6,3 т.п.н., которая возникла в результате опосредованного микрогомологией соединения концов, а не неаллельной гомологичной рекомбинации. Секретируемый белковый продукт лишен домена узнавания фактора H и демонстрирует нарушенную регуляцию комплемента на клеточной поверхности. Тот факт, что образование этого гибридного гена возникло как событие de novo, позволяет предположить, что этот кластер представляет собой динамическую область генома, в которой могут возникать дополнительные геномные нарушения (PubMed: 26490391).Гены CFHR1-4

25 августа 2017 года Blueprint Genetics исключила гены CFHR1, CFHR2, CFHR3, CFHR4 из трех диагностических панелей NGS, включая панель первичного иммунодефицита, панель нарушений системы комплемента и панель гемолитико-уремического синдрома. Это было сделано из-за обширной гомологии между этими генами, что затрудняло или даже делало невозможным надежное определение числа копий этих генов с помощью методов NGS с короткой длиной считывания. Более того, гомозиготные или гетерозиготные делеции, включающие эти гены, распространены в популяции, даже если их много у пациентов с aHUS. Опираясь на три оценки: 1) более высокий предел распространенности aHUS (9 на 1 000 000), 2) частоту гомозиготной делеции CFHR1 (2%) и 3) предположение, что все случаи aHUS будут вызваны этим дефектом (переоценка эффекта), у нас остается тот факт, что 99. 95% людей с гомозиготной делецией CFHR1 никогда не заболеют aHUS. Таким образом, мы считаем, что высвобождение количества копий генов CFHR1-4 может вводить в заблуждение и не будет полезным в клинической практике. Мы полагаем, что соединение генов между CFH и CFHR1-4 могут быть механизмом, объясняющим связь между делециями гена CFHR1-4 и aHUS. Однако такого рода изменения не могут быть надежно обнаружены методами таргетного секвенирования.

Гены, входящие в панель:

* Тип наследования: аутосомно-доминантный (AD), аутосомно-рецессивный (AR), митохондриальный (mi), Х-сцепленный (XL), Х-сцепленный доминантный (XLD) и Х-сцепленный рецессивный (XLR);

** ClinVar, HGMD - количество вариантов гена, классифицированных как патогенные или вероятно патогенные в базе данных ClinVar, HGMD.

Возможная персонализация панели

В панель разрешается добавить дополнительные гены (до 200), которые связаны с симптомами, и удалить любые гены (чтобы осталось не меньше 2). Стоимость панели может меняться, а именно:
- малая панель 2-25 генов ,
- средняя панель 26-125 генов ,
- большая панель более 126 генов .

Преимущества этого теста

• Лаборатория (США), аккредитованная САР
• Персонал, сертифицированный CLIA, проводит клинические испытания в лаборатории, сертифицированной CLIA.
• Мощные технологии секвенирования, передовые методы обогащения мишеней и конвейеры точной биоинформатики обеспечивают превосходную аналитическую производительность.
• Тщательное составление клинически эффективных и научно обоснованных генных панелей
• Общедоступная аналитическая проверка, демонстрирующая полную информацию о производительности теста
• Анализ некодирующих вариантов, вызывающих заболевания
• Анализ делеций и дупликаций
• Строгая схема классификации вариантов
• Систематический рабочий процесс клинической интерпретации с использованием проприетарного программного обеспечения, обеспечивающего точную и прослеживаемую обработку данных NGS.
• Подробнейшее клиническое заключение на английском и украинском языках

Что дальше?

Если анализ выявил варианты, являющиеся возможной причиной болезни, можно проверить наличие этих вариантов у родителей. Анализ отдельных мутаций по Сэнгеру.

Если анализ не выявил вариантов, являющиеся возможной причиной болезни, можно расширить тестирование до полного экзома Расширение панели до полного экзома. Кроме того, возможно бесплатно получить сырые данные и делать повторную оценку каждые несколько лет. Возможно, со временем науке станут известны новые генетические факторы заболевания.

Как пройти исследование

Требования сдачи крови натощак нет (легкий завтрак и незадолго до взятия крови выпить 1-2 стакана обычной негазированной воды; детей обязательно поить негазированной водой порциями, до 150-200 мл, в течение 30 минут), в день сдачи крови не употреблять медикаменты (включая витамины и БАД), накануне исключить прием жареной и жирной пищи, исключить за 32 часа алкоголь.

Проводится забор венозной крови в пробирку с ЭДТА 4 мл.

Необходимо предоставить (взять с собой или прислать нам на электронную почту) заключение врача с подробной клинической картиной (описание симтомов, диагноз/предварительный диагноз) и фото исследуемого пациента (если есть фенотипически значимые особенности), заполнить в электронном виде анкету.

Во всех случаях по результатам секвенирования необходимо получить консультацию врача-генетика.