Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
У панель Вроджена стаціонарна нічна сліпота входить 20 генів, також включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій.
Ідеально підходить для пацієнтів із клінічною підозрою/діагнозом уродженої стаціонарної нічної сліпоти. Гени цієї панелі включені в панель дистрофії сітківки.
Вроджена стаціонарна нічна сліпота (CSNB) — це непрогресуюче захворювання сітківки, яке характеризується порушенням нічного або слабкого зору або затримкою адаптації до темряви, поганою гостротою зору (від 20/30 до 20/200), міопією, ністагмом, косоокою. колірним зором та аномаліями очного дна. CSNB можна поділити відповідно до типу спадкування, який може бути Х-зчепленим, аутосомно-рецесивним або аутосомно-домінантним. X-зчеплений CSNB становить 57,9% випадків, аутосомно-рецесивний і спорадичний CSNB становлять 40%, включаючи 23,6% з аномалією очного дна, а 2,1% випадків, що залишилися, мають аутосомно-домінантний CSNB. Неповна форма Х-зчепленого CSNB (CSNB2) викликана мутаціями в гені CACNA1F, а повна форма Х-зчепленого CSNB (CSNB1) спричинена дефектами в гені NYX. Хвороба Огучі – рідкісна аутосомно-рецесивна форма CSNB, пов'язана із зміною кольору очного дна та аномально повільною темновою адаптацією.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
CABP4 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AR | 6 | 11 |
CACNA1F | Аландська хвороба очей, дистрофія паличок колб, Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | XL | 39 | 182 |
CACNA2D4 | Дистрофія колб сітківки | AR | 3 | 9 |
CYP4V2 | Пігментний ретиніт, кристалічна корнеоретинальна дистрофія Бієтті | AR | 31 | 94 |
FRMD7 | Ністагм, інфантильний періодичний альтернуючий | XL | 15 | 95 |
GNAT1 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AD/AR | 5 | 10 |
GNB3 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна, тип 1H | AR | 3 | 6 |
GPR179 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AR | 13 | 16 |
GRK1 | Хвороба Огучі | AR | 5 | 23 |
GRM6 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AR | 11 | 38 |
LRIT3 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AR | 4 | 9 |
NYX | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | XL | 12 | 89 |
PDE6B | Ретиніт пігментний, нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AD/AR | 35 | 125 |
RDH5 | Білоточкове очне дно | AR | 11 | 51 |
RHO | Пігментний ретиніт, Нічна сліпота, вроджений стаціонарний, Білоточковий ретиніт | AD/AR | 58 | 212 |
RLBP1 | Ньюфаундлендська паличко-колбочкова дистрофія, Білоточкове очне дно, Ботнічний Дистрофія сітківки, білий точковий ретиніт | AR | 9 | 37 |
RPE65 | Пігментний ретиніт, уроджений амавроз Лебера | AD/AR | 31 | 197 |
SAG | Пігментний ретиніт, хвороба Огучі | AD/AR | 6 | 15 |
SLC24A1 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна, тип 1D | AR | 7 | 26 |
TRPM1 | Нічна сліпота, вроджена стаціонарна | AR | 21 | 82 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз вияв варіанти, які є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна безкоштовно отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Вимоги здачі крові натще немає (легкий сніданок і незадовго до взяття крові випити 1-2 склянки звичайної негазованої води; дітей обов'язково напувати негазованою водою порціями, до 150-200 мл, протягом 30 хвилин), в день здачі крові не вживати медикаменти (включаючи вітаміни та БАД), напередодні виключити прийом смаженої та жирної їжі, виключити за 32 години алкоголь.
Проводиться забір венозної крові в пробірку з ЕДТА 4 мл.
Необхідно надати (взяти з собою або надіслати нам на електронну пошту) висновок лікаря з детальною клінічною картиною (опис симтомів, діагноз/попередній діагноз) та фото досліджуваного пацієнта (якщо є фенотипно значущі особливості), заповнити в електронному вигляді анкету.
У всіх випадках за результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.