Аналізи ДНК в Україні
Всі аналізи/Панелі (секвенування NGS)
В панель Нейропатія Шарко-Марі-Тута входить 153 гени, включена оцінка некодуючих варіантів, виявлення делецій та дуплікацій (ХМА).
Ідеальна панель для пацієнтів із клінічною підозрою на Нейропатію Шарко-Марі-Тута.
Невропатія Шарко-Марі-Тута, також відома як спадкова моторна/сенсорна невропатія (HMSN), є найбільш поширеною генетичною причиною невропатії. Поширеність оцінюється як 1:3300. ШМТ характеризується широкою генетичною гетерогенністю і може успадковуватися за аутосомно-домінантним, аутосомно-рецесивним або Х-зчепленим типом. Невропатія Шарко-Марі-Тута виникає внаслідок ураження периферичних нервів, які можуть впливати на рухову систему та/або сенсорну систему. Особи з Невропатією Шарко-Марі-Тута відчувають симетричну, повільно прогресуючу дистальну моторну невропатію рук і ніг, що зазвичай починається в першому-третьому десятилітті життя і призводить до слабкості та атрофії м'язів стоп та/або рук. Часто трапляється деформація стопи Pes Cavus. Нейропатії ШМТ можна розділити на демієлінізуючі та аксональні форми.
Ген | Асоційований фенотип | Спадкоємність.* | ClinVar** | HGMD** |
---|---|---|---|---|
AARS | Епілептична енцефалопатія, рання інфантильна, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 9 | 16 |
AGTPBP1 | невропатія | AR | 3 | 1 |
AIFM1 | Глухота, комбінований дефіцит окисного фосфорилювання 6, синдром Коучка | XL | 27 | 31 |
AMACR | Дефіцит альфа-метилацил-КоА-рацемази, дефект синтезу жовчних кислот | AR | 3 | 8 |
ARHGEF10 | Уповільнена швидкість нервової провідності | AD | 4 | 12 |
ATAD3A | Синдром Харела-Юна | AD/AR | 4 | 17 |
ATL1 | Спастична параплегія, нейропатія, спадкова сенсорна | AD | 29 | 84 |
ATL3 | нейропатія, спадкова сенсорна | AD | 1 | 4 |
ATP1A1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 8 | 10 |
ATP7A | Хвороба Менкеса, синдром потиличного рогу, спинальна м'язова атрофія, дистальна, Х-зчеплена 3 | XL | 116 | 354 |
BAG3 | Дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП), міопатія, міофібрилярна | AD | 39 | 62 |
BICD2 | Дитяча проксимальна спинальна м'язова атрофія з контрактурами | AD | 12 | 28 |
BSCL2 | Ліподистрофія, вроджена генералізована, Енцефалопатія, прогресуюча, Нейропатія, дистальна спадкова моторна, тип VA, Хвороба Шарко-Марі-Тута 2 тип, Синдром Сільвера, Синдром спастичної параплегії Сільвера, Спастична параплегія | AD/AR | 34 | 50 |
C12ORF65 | Спастична параплегія, дефіцит комбінованого окисного фосфорилювання | AR | 10 | 11 |
CCT5 | Нейропатія, спадкова сенсорна, зі спастичною параплегією | AR | 1 | 1 |
CHCHD10 | Міопатія, ізольована мітохондріальна, лобово-скронева деменція та/або бічний аміотрофічний склероз 2, спинальна м'язова атрофія, тип Джокела | AD | 4 | 26 |
COA7 | Спиноцеребеллярна атаксія, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 2 | 7 |
COX10 | Синдром Лея, дефіцит мітохондріального комплексу IV | AR | 52 | 13 |
COX6A1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 2 | 1 |
CTDP1 | Вроджена катаракта, лицьовий дисморфізм та невропатія | AR | 1 | 1 |
CYP27A1 | Церебротендинозний ксантоматоз | AR | 69 | 110 |
DCAF8 | Гігантська аксональна нейропатія 2, аутосомно-домінантна | AD | 1 | 1 |
DCTN1 | Синдром Перрі, невропатія, дистальний спадковий моторний | AD | 10 | 52 |
DHTKD1 | 2-аміноадипінова та 2-оксоадипінова ацидурія, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 11 | 18 |
DNAJB2 | Спинальна м'язова атрофія, дистальна, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 9 | 5 |
DNM2 | Міопатія, летальна акінезія та скелетно-м'язові аномалії з крововиливами в мозок та сітківку, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 28 | 47 |
DNMT1 | Невропатія, спадкова сенсорна, мозочкова атаксія, глухота та нарколепсія | AD | 9 | 20 |
DST | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна | AR | 13 | 7 |
DYNC1H1 | Спинальна м'язова атрофія, хвороба Шарко-Марі-Тута, розумова відсталість | AD | 60 | 71 |
EGR2 | Невропатія, хвороба Дежеріна-Сотта, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 13 | 21 |
FAM134B | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна | AR | 8 | 5 |
FBLN5 | Cutis laxa, дегенерація жовтої плями, вікова | AD/AR | 13 | 22 |
FBXO38 | Нейронопатія, дистальна спадкова рухова | AD | 1 | 5 |
FGD4 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 21 | 27 |
FIG4 | Бічний аміотрофічний склероз, полімікрогірія, двостороння потилична, синдром Юніса-Варона, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 34 | 69 |
FXN | атаксія Фрідрейха | AR | 13 | 63 |
GAN | Гігантська аксональна нейропатія | AR | 18 | 76 |
GARS | Нейропатія, дистальна спадкова моторика, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 19 | 38 |
GDAP1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 39 | 100 |
GJB1 | невропатія Шарко-Марі-Тута | XL | 98 | 495 |
GNB4 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 2 | 5 |
GNE | Проксимальна міопатія та офтальмоплегія, міопатія Нонака, сіалурія | AD/AR | 78 | 214 |
GSN | Амілоїдоз фінського типу | AD | 3 | 13 |
HADHB | Дефіцит трифункціонального білка | AR | 20 | 65 |
HARS | Хвороба Шарко-Марі-Тута, аксональна, тип 2W, синдром Ушера, тип 3B | AD/AR | 6 | 12 |
HINT1 | Аксональна нейропатія з нейроміотонією | AR | 11 | 15 |
HK1 | Гемолітична анемія, несфероцитарна, обумовлена дефіцитом гексокінази, пігментний ретиніт 79, нейропатія моторна та сенсорна, тип Russe (хвороба Шарко-Марі-Тута тип 4G) | AD/AR | 9 | 7 |
HSPB1 | Нейропатія, дистальна спадкова моторика, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 27 | 44 |
HSPB8 | Хвороба Шарко-Марі-Тута, дистальна спадкова моторна нейронопатія | AD | 6 | 9 |
IGHMBP2 | Спинальна м'язова атрофія, дистальна, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 52 | 128 |
IKBKAP | Дизавтономія, сімейна, спадкова сенсорна та вегетативна невропатія | AR | 47 | 6 |
INF2 | Гломерулосклероз, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 20 | 67 |
KARS | Хвороба Шарко-Марі-Тута, глухота, аутосомно-рецесивна | AR | 9 | 23 |
KIF1A | Спастична параплегія, нейропатія, спадкова сенсорна, розумова відсталість | AD/AR | 63 | 42 |
KIF1B | Феохромоцитома, нейробластома, хвороба Шарко-Марі-Тута, тип 2А1 | AD | 7 | 12 |
KIF5A | Спастична параплегія | AD | 18 | 62 |
LDB3 | Дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП), міопатія, міофібрилярна | AD | 9 | 14 |
LITAF | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 10 | 18 |
LMNA | Синдром серця-рука, словенський, поясно-кінцева м'язова дистрофія, м'язова дистрофія, вроджена, пов'язана з LMNA, ліподистрофія (Данніган), м'язова дистрофія Емері-Дрейффуса, синдром Малуфа, дилатаційна кардіоміопатія (ДКМП), мандібулоакральна дисплазія типу | AD/AR | 250 | 564 |
LRSAM1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 15 | 14 |
MARS | Інтерстиціальне захворювання легень та печінки, хвороба Шарко-Марі-Тута, хвороба Шарко-Марі-Тута, аксональний тип 2U | AD/AR | 9 | 13 |
MCM3AP | невропатія Шарко-Марі-Тута | AR | 8 | 19 |
MED25 | Синдром Базеля-Ванагайта-Сміріна-Йосефа, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 4 | 5 |
MFN2 | Спадкова моторна та сенсорна невропатія, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 70 | 223 |
MME | Спиноцеребеллярна атаксія 43, хвороба Шарко-Марі-Тута, аксональна, тип 2Т | AD/AR | 14 | 21 |
MORC2 | Тип хвороби Шарко-Марі-Тута, аксональний, тип 2Z | AD | 6 | 17 |
MPV17 | Синдром виснаження мітохондріальної ДНК | AR | 35 | 50 |
MPZ | Невропатія, синдром Руссі-Леві, хвороба Дежеріна-Сотта, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 108 | 241 |
MT-ATP6 | Нейропатія, атаксія та пігментний ретиніт, спадкова оптична невропатія Лебера, атаксія та полінейропатія, з початком у дорослому віці, кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна, синдром Лі, стріатонігральна дегенерація, інфантильна, мітохондріальна | Mitochondrial | 19 | |
MT-ATP8 | Кардіоміопатія, апікальна гіпертрофічна та нейропатія, Кардіоміопатія, інфантильна гіпертрофічна | Mitochondrial | 4 | |
MT-CO1 | Міоглобінурія, рецидивна, спадкова оптична нейропатія Лебера, сидеробластна анемія, дефіцит цитохром-С-оксидази, глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 17 | |
MT-CO2 | Дефіцит цитохрому з оксидази | Mitochondrial | 8 | |
MT-CO3 | Дефіцит цитохрому з оксидази, спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 9 | |
MT-CYB | Mitochondrial | 69 | ||
MT-ND1 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера | Mitochondrial | 21 | |
MT-ND2 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 6 | |
MT-ND3 | Атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 7 | |
MT-ND4 | Спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 11 | |
MT-ND4L | Спадкова оптична нейропатія Лебера | Mitochondrial | 2 | |
MT-ND5 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, спадкова оптична нейропатія Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 19 | |
MT-ND6 | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, онкоцитома, спадкова оптична нейропатія Лебера, атрофія та дистонія зорового нерва Лебера, дефіцит мітохондріального комплексу I | Mitochondrial | 16 | |
MT-RNR1 | Глухота, мітохондріальна | Mitochondrial | 3 | |
MT-RNR2 | Токсичність/резистентність до хлорамфеніколу | Mitochondrial | 2 | |
MT-TA | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TC | Мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 3 | |
MT-TD | Mitochondrial | 1 | ||
MT-TE | Діабет-синдром глухоти, Мітохондріальна міопатія, інфантильна, транзиторна, Мітохондріальна міопатія при цукровому діабеті | Mitochondrial | 5 | |
MT-TF | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, нефропатія, тубулоінтерстиціальна, енцефалопатія, мітохондріальна, епілепсія, мітохондріальна, міопатія, мітохондріальна, мітохондріальна енцефаломіопатія з ілактоацид | Mitochondrial | 7 | |
MT-TG | Mitochondrial | 3 | ||
MT-TH | Mitochondrial | 4 | ||
MT-TI | Mitochondrial | 7 | ||
MT-TK | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, синдром Лея | Mitochondrial | 5 | |
MT-TL1 | Дефіцит цитохром-с-оксидази, міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди, діабет-синдром глухоти, синдром циклічного блювання, СВДС, | Mitochondrial | 14 | |
MT-TL2 | Мітохондріальне мультисистемне захворювання, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальна міопатія, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 5 | |
MT-TM | Синдром Лея, мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 1 | |
MT-TN | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія, мітохондріальне мультисистемне захворювання | Mitochondrial | 3 | |
MT-TP | Mitochondrial | 2 | ||
MT-TQ | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TR | Енцефалопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 2 | |
MT-TS1 | Міоклонічна епілепсія з рваними червоними волокнами, мітохондріальна міопатія, енцефалопатія, лактоацидоз та інсультоподібні епізоди | Mitochondrial | 10 | |
MT-TS2 | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 2 | |
MT-TT | Mitochondrial | 5 | ||
MT-TV | Гіпертрофічна кардіоміопатія (ГКМП), синдром Лі, мітохондріальне мультисистемне захворювання, мітохондріальна енцефаломіопатія з лактоацидозом та інсультоподібними епізодами | Mitochondrial | 3 | |
MT-TW | Синдром Лі, міопатія, мітохондріальна | Mitochondrial | 8 | |
MT-TY | Мітохондріальний мультисистемний розлад | Mitochondrial | 4 | |
MTMR2 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 13 | 23 |
MYOT | Міопатія, міофібрилярна, М'язова дистрофія, поясно-кінцева, 1А, Міопатія, сфероїдне тіло | AD | 6 | 16 |
NDRG1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 6 | 8 |
NEFH | Хвороба Шарко-Марі-Тута, аксональна, тип 2СС | AD/AR | 4 | 21 |
NEFL | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 24 | 40 |
NGF | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна | AR | 2 | 6 |
NTRK1 | Нечутливість до болю, вроджена, з ангідрозом, Медулярна карцинома щитовидної залози, сімейна | AR | 38 | 123 |
PDK3 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | XL | 1 | 3 |
PLEKHG5 | Спинальна м'язова атрофія, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 16 | 8 |
PMP2 | 1 | 3 | ||
PMP22 | Нейропатія, запальна демієлінізуюча, синдром Руссі-Леві, хвороба Дежеріна-Сотта, спадкова невропатія, зі схильністю до паралічів тиску, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD/AR | 49 | 165 |
PNKP | Епілептична енцефалопатія, рання інфантильна, атаксія-очірухлива | AR | 34 | 23 |
POLG | Розлади спектру нейропатії атаксії, пов'язаної з POLG, сенсорна атаксія, дизартрія та офтальмопарез, синдром Альперса, прогресуюча зовнішня офтальмоплегія з недостатністю мітохондріальної ДНК, синдром виснаження мітохондріальної ДНК | AD/AR | 89 | 290 |
POLG2 | Прогресуюча зовнішня офтальмоплегія з недостатністю мітохондріальної ДНК | AD | 5 | 14 |
PRDM12 | Невропатія, спадкова сенсорно-вегетативна, VIII тип | AR | 7 | 11 |
PRPS1 | Надактивність фосфорибозилпірофосфатсинтетази I, синдром Артса, хвороба Шарко-Марі-Тута, Х-зчеплений рецесивний, 5, Глухота, Х-зчеплений 1 | XL | 27 | 32 |
PRX | Хвороба Дежеріна-Сотта, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 26 | 55 |
RAB7A | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 5 | 7 |
REEP1 | Спастична параплегія, Дистальна спадкова моторна нейронопатія | AD | 16 | 60 |
SACS | Спастична атаксія Шарлевуа-Сагене | AR | 254 | 262 |
SBF1 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 5 | 10 |
SBF2 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 25 | 21 |
SCN11A | Епізодичний больовий синдром, сімейний, 3, Невропатія, спадкова сенсорно-вегетативна, VII тип | AD | 8 | 20 |
SCN9A | Пароксизмальний сильний больовий розлад, невропатія дрібних волокон, еритермалгія, первинна, генералізована епілепсія з фебрильними судомами плюс, тип 7, нечутливість до болю, вроджена, аутосомно-рецесивна | AD/AR | 61 | 125 |
SCYL1 | Спиноцеребеллярна атаксія, аутосомно-рецесивна 21 | AR | 12 | 6 |
SEPT9 | Аміотрофія, спадкова невралгія | AD | 4 | 11 |
SETX | Атаксія з окорухової апраксією, Бічний аміотрофічний склероз, Ювенільна, Спіноцеребеллярна атаксія | AD/AR | 36 | 210 |
SH3TC2 | Мононевропатія серединного нерва, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 63 | 89 |
SLC12A6 | Агенезія мозолистого тіла з периферичною невропатією (синдром Андермана) | AD/AR | 43 | 19 |
SLC25A46 | Нейропатія, спадкова моторно-сенсорна, тип VIB | AR | 14 | 17 |
SLC52A2 | Синдром Брауна-Віалетто-Ван Лаєра | AR | 27 | 25 |
SLC52A3 | Хвороба Фаціо-Лонде, синдром Брауна-Віалетто-Ван Лаера | AR | 30 | 42 |
SMAD3 | Синдром аневризми-остеоартриту, синдром Лойса-Дитца | AD | 48 | 82 |
SPG11 | Спастична параплегія, Бічний аміотрофічний склероз, Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 162 | 274 |
SPTBN4 | Міопатія вроджена з невропатією та глухотою | AR | 6 | 7 |
SPTLC1 | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна | AD | 8 | 11 |
SPTLC2 | Спадкова сенсорна та вегетативна невропатія | AD | 5 | 14 |
SURF1 | Синдром Лея, хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 50 | 101 |
TFG | Спастична параплегія, Спадкова моторна та сенсорна невропатія, проксимальна | AR | 4 | 7 |
TRIM2 | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AR | 5 | 8 |
TRPV4 | Метатропна дисплазія, Спондилоефіфізарна дисплазія типу Маро, Парастремматична карликовість, Спадкова моторна та сенсорна невропатія, Спондилометафізарна дисплазія типу Козловського, Спинальна м'язова атрофія, Хвороба Шарко-Маріо-Му ціева артропатія з брахідактилією< /td> | AD | 61 | 78 |
TTR | Дистранстиретинемічна гіпертироксинемія, амілоїдоз, спадковий, пов'язаний з транстиретином | AD | 52 | 148 |
TYMP | Синдром виснаження мітохондріальної ДНК | AR | 84 | 94 |
UBA1 | Спинальна м'язова атрофія, інфантильна | XL | 3 | 5 |
VCP | Бічний аміотрофічний склероз, міопатія з тільцями включення з раннім початком хвороби Педжета, хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 17 | 61 |
WNK1 | Невропатія, спадкова сенсорна та вегетативна, псевдогіпоальдостеронізм | AD/AR | 14 | 9 |
YARS | Хвороба Шарко-Марі-Тута | AD | 6 | 11 |
ZFYVE26 | Спастична параплегія 15 | AR | 63 | 39 |
* Тип успадкування: аутосомно-домінантний (AD), аутосомно-рецесивний (AR), мітохондріальний (mi), Х-зчеплений (XL), Х-зчеплений домінантний (XLD) та Х-зчеплений рецесивний (XLR); ** ClinVar, HGMD - кількість варіантів гена, класифікованих як патогенні або ймовірно патогенні в базі даних ClinVar, HGMD.
В панель дозволяється додати додаткові гени (до 200), пов'язані з симптомами, та видалити будь-які гени (щоб залишилося не менше 2). Вартість панелі може змінюватися, а саме:
- мала панель 2-25 генів ,
- середня панель 26-125 генів ,
- велика панель понад 126 генів .
Якщо аналіз вияв варіанти, які є можливою причиною хвороби, можна перевірити наявність цих варіантів у батьків. Аналіз окремих мутацій по Сенгеру.
Якщо аналіз не виявив варіантів, які є можливою причиною хвороби, можна розширити тестування до повного екзома Розширення панелі до повного екзома. Крім того, можна безкоштовно отримати сирі дані і робити повторну оцінку кожні кілька років. Можливо, згодом науці стануть відомі нові генетичні чинники захворювання.
Вимоги здачі крові натще немає (легкий сніданок і незадовго до взяття крові випити 1-2 склянки звичайної негазованої води; дітей обов'язково напувати негазованою водою порціями, до 150-200 мл, протягом 30 хвилин), в день здачі крові не вживати медикаменти (включаючи вітаміни та БАД), напередодні виключити прийом смаженої та жирної їжі, виключити за 32 години алкоголь.
Проводиться забір венозної крові у пробірку з ЕДТА 4 мл.
Необхідно надати (взяти з собою або надіслати нам на електронну пошту) висновок лікаря з детальною клінічною картиною (опис симтомів, діагноз/попередній діагноз) та фото досліджуваного пацієнта (якщо є фенотипно значущі особливості), заповнити в електронному вигляді анкету.
У всіх випадках за результатами секвенування необхідно отримати консультацію лікаря-генетика.